微生物杀虫剂是运用微生物的活体制成的。在自然界，存在着许多对害虫有致病效果的微生物，运用这种致病性来防治害虫是一种有用的生物防治办法。从这些病原微生物中筛选出施用便利、药效安稳、对人畜和环境安全的菌种，进行工业规划的出产开发，然后制成微生物杀虫剂。
微生物杀虫剂首要可分为真菌、细菌和病毒三类。在其他微生物中，放线菌一般运用其代谢产品抗生素，而不直接运用其活体作杀虫剂。原生动物、线虫和立克次氏体等微生物的运用研讨得很少，没有实用化。
已发现的昆虫病原线种，寄生规划很广，但开发成杀虫剂的不多，已实验成功并有必定规划运用的有：运用白僵菌防治马铃薯甲虫、大豆食心虫、松毛虫和玉米螟；运用绿僵菌防治金龟子、孑孓；运用汤普森多毛菌防治柑橘锈螨；运用轮枝孢防治温室蚜虫；运用座壳孢防治粉虱和介壳虫等。
微生物杀虫剂中研讨开发最成功的是运用芽孢杆菌作杀虫剂，首要种类为苏云金杆菌，已大规划的运用于农作物、森林、粮仓和蚊蝇等的防治。苏云金杆菌发现于20世纪初，30年代开端实用化，50年代即有工业出产，70年代以来开展较快，80年代全世界年销售额超越2000万美元。我国在70年代已大量出产，有青虫菌、杀螟杆菌等许多商品名称。苏云金杆菌有许多变种，其芽孢内含毒蛋白晶体，通称δ-内毒素，是杀虫的首要成分。当孢子进入害虫消化道后，毒素被活化，使害虫麻木瘫痪而死。因为各变种所含蛋白晶体的结构不同，其毒力和适用的害虫目标也不同。例如运用较广的寇氏变种，用于防治鳞翅目幼虫;以色列变种用于防治孑孓。其他已开发运用的细菌杀虫剂还有日本甲虫芽孢杆菌，用于防治金龟子幼虫颇有用。
寄生于农业害虫的病毒已发现约 200种，有些已被开发作为病毒杀虫剂。其间大大都归于杆状病毒的核多角体病毒，少量是颗粒体病毒。昆虫病毒有高度的专注寄生性，一般一种病毒只侵染一种昆虫，而对他种昆虫和人无害，因而不搅扰生态环境。但因为病毒只能用害虫活体培育增殖，使大规划工业出产受到限制。现已小规划商品化的病毒杀虫剂大都用于防治鳞翅目害虫，例如棉铃虫、舞毒蛾、斜纹夜蛾、天幕毛虫、菜粉蝶等。我国在80年代已广泛实验推行病毒杀虫剂。
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